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一文讓你輕松讀懂CRISPR檢測技術原理

來源:網(wǎng)絡

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日期:2025-04-25 10:04:04

  CRISPR/Cas系統(tǒng)來源于細菌的免疫系統(tǒng),在原核生物中,CRISPR-Cas系統(tǒng)作為免疫系統(tǒng),利用CRISPR RNAs(crRNAs)作為引導分子,靶向識別入侵核酸,在抵御外來病毒入侵。

一文讓你輕松讀懂CRISPR檢測技術原理(圖1)

  1、適應階段:將外來的病毒或噬菌體的DNA片段作為間隔序列(spacer)整合到CRISPR array;

  3、干擾階段:成熟的crRNA與Cas蛋白形成核糖白復合體,crRNA引導Cas蛋白特異性靶向切割入侵者的核酸,達到免疫防御的目的。

一文讓你輕松讀懂CRISPR檢測技術原理(圖2)

  知道了CRISPR/Cas的來源及在細菌免疫系統(tǒng)中發(fā)揮的作用,人們開始將此免疫系統(tǒng)應用在基因編輯上,那么我們再一起看一下CRISPR/Cas系統(tǒng)是如何應用到CRISPR檢測的呢?

  CRISPR檢測技術所用的Cas蛋白主要有Cas12、Cas13和Cas14,與Cas9不同的是,Cas12、Cas13和Cas14除了具有特異性切割靶序列的功能外,在切割靶標序列之后,還具有非特異性切割其它核酸序列的功能(即Cas蛋白的反式切割活性)。在反式切割激活的狀態(tài)下,可非特異性切割任意單鏈,將體系中的熒光標記探針切碎,即可用來檢測信號。由此開展各種基因檢測技術。

  Cas12a處理其自身的crRNA5’端,dsDNA靶標識別始于WED和PI結構域的PAM識別,從而促進dsDNA靶標的展開。r-環(huán)的形成是由TS結合crRNA片段而啟動的。過程的kaiyun官方開云crRNA-TS配對,同時TS-NTS展開導致形成完整的r-環(huán)。crRNA-TS DNA氫化誘導REC葉的構象變化,導致RuvC結構域的催化位點的變構解封。NTS結合槽引導移位的NTS向RuvC催化位點移動,導致NTS的順式裂解。隨后,進一步解開pam-遠端TS-NTS雙鏈,使TS進入RuvC催化位點,導致TS的順式裂解。pam-遠端dsDNA被釋放,而PAM-近端dsDNA仍然與Cas12a-crRNA復合物結合。這使得Cas12a保持在一個催化激活的構象中,這允許非靶標ssDNA的反式裂解。主要概括為以下四個步驟:

  1、Cas12a蛋白的WED和PI結構域識別dsDNA靶標的PAM序列,從而促進dsDNA靶標的展開。

  3、REC遠離RuvC,RuvC結構域切割位點暴露,順式切割非靶標鏈和靶標鏈。

一文讓你輕松讀懂CRISPR檢測技術原理(圖3)

  一句話概括來說CRISPR檢測就是由靶標核酸激活Cas蛋白的反式切割活性,將體系中的熒光標記探針切碎,發(fā)出熒光信號,完成靶標核酸檢測的過程。

一文讓你輕松讀懂CRISPR檢測技術原理(圖4)

  我們是專注于做CRISPR檢測的團隊,自主研發(fā)的Cas12a蛋白,Cas12b蛋白,Cas13a蛋白活性遠高于市面上其它公司,如果你也在正好在做CRISPR檢測,歡迎咨詢:(微信同號)。

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